Концепция международного проекта

Концепция международного проекта «Протеом человека» предложена проф. Джоном Бергероном на совещании представителей HUPO, которое состоялось в 2008 г. на Барбадосе и положило начало проекту. Кроме принципа геноцентричности в ходе совещания обсуждался программный документ — «White paper». Содержание этого документа отображено на схеме. В основе выполнения проекта лежат три группы методических подходов:

масс-спектрометрическая идентификация,
иммуногистохимическое картирование протеома
анализ белок-белковых взаимодействий в рамках сетевой модели системной биологии.

Три «движка» проекта «Протеом человека» Скопированно с «A Human Proteome Project Determining and characterizing the proteins encoded by the human genome.»

Зарубежные проекты

HPDq — проект по количественной идентификации 21 тыс. белков
ProteomeAltlas — проект по иммуногистохимическому анализу белков в масштабе всего протеома

Стоимость проекта (Anderson et al., MCP, 2009)

Cтоимость создания системы для количественного определения 2 тыс. белков оценивается в 50 млн. долларов США
Cтоимость такой системы для всего протеома (18 тыс. белков) — более 250 млн. долларов США

Несмотря но то, что рассмотренный на барбадоссоком совещании документ носит выраженный интегративный характер, тем не менее он не затрагивает принципиального ограничения современной протеомики, заключающегося в низкой чувствительности аналитических методик. Российский вклад в международный проект заключается в развитии методов идентификации ультранизкокопийных белков за счет применения технологий детекции единичных молекул и их комплексов.