Российская часть международного проекта

Федерации в международном проекте заключается в интеграции ведущихся в России разработок в области протеомики в рамках единой технологической задачи идентификации белков, кодируемых в 18 хромосоме генома человека.

Задачами, закрепленными за российской частью проекта, являются:

теоретико-экспериментальная оценка общего числа белков, существующих в организме человека, и обоснование выбора биоматериала для исследования – крови и ткани печени;
обоснование выбора в качестве объекта исследований 18 хромосомы человека с учетом двух критериев: небольшое число экспрессируемых белков и наличие значительного количества SNP (Single-nucleotide polymorphism), ассоциированных с возникновением социально-значимых заболеваний;
компьютерный анализ числа возможных транскриптов выбранной хромосомы (биоинформатика);
идентификация транскриптов 18-й хромосомы методами транскриптомики;
идентификация высоко- и среднекопийных белков 18-й хромосомы генома человека с использованием стандартных протеомных методов;
разработка новых подходов для идентификации низкокопийных белков путем комбинации технологий предварительного удаления высококопийных белков в биоматериале (плазме крови и ткани печени) с атомно-силовой микроскопией и масс-спектрометрией;
каталогизация пептидов, относящихся к 18-й хромосоме (пептидомика);
протеотипирование белков, экспрессируемых 18-й хромосомой генома человека;
исследование индивидуальной изменчивости протеома здоровых доноров, отобранных врачебно-экспертной комиссией.