Технологии

Цель российской части проекта – определение протеома 18-й хромосомы человека на уровне чувствительности 1 копия белка (пептида) на 1 мкл плазмы крови или на 10⁷ клеток печени и HepG2, выяснение путей взаимодействия белков 18-й хромосомы человека со всеми остальными белками этих клеток (расшифровка интерактома) и создание базы знаний.

Нерешенной проблемой в протеомике является низкая чувствительность протеомных технологий. В геномике существует полимеразная цепная реакция (ПЦР), позволяющая преодолеть барьер чувствительности. Размножая молекулы нуклеиновых кислот, можно начать даже с одной молекулы, существующей в каком-то биологическом объекте и добиться увеличения ее концентрации до такого уровня, когда ее можно обнаружить. В протеомике это невозможно, поэтому главной проблемой является увеличение чувствительности методов идентификации белков.

Теоретически, чувствительность может быть увеличена до уровня 10^-24 М (обратное число Авогадро), что соответствует 1 копии белка на литр. На сегодняшний день стало возможным увеличение чувствительности до 10^-18 М, что соответствует одной копии белка на 1 µL. Это стало достижимым благодаря совмещению технологии MRM (Multiple Reaction Monitoring) – масс-спектрометрии с необратимым связыванием белков на BrCN-серофоразе для их концентрирования. На наш взгляд, достигнутый уровень чувствительности является достаточным для выполнения проекта «Протеом человека».